El 'Edge of Ocean' será la nueva sede de la cumbre de Tokyo, custodiada por más de 22.000 policías, ¡ocurre una gran explosión! Allí se encuentra Tooru Amuro, miembro de la organización secreta conocida como 'Zero' que controla la policía de seguridad pública de todo el país. Conan sospecha de una explosión ocurrida días antes de la cumbre y del misterioso comportamiento de Amuro, que se mueve en secreto. En ese momento se encuentran unas huellas digitales en la escena del crimen y coinciden con las huellas de Kogoro Mouri, ¡quien perteneció a la policía en el pasado! ¿Acaso se trata de una conspiración? Conan y Amuro inician la investigación alrededor del arresto de Kogoro.

Las hechiceras Lina Inverse y Naga la Serpiente están disfrutando de una comida en un villiage cuando los residentes de repente se retiran en el interior y dos ejércitos - una de hombres y otra de una niña y una tribu de dragones. Aunque el gobernador de la ciudad intenta originalmente para convencer a Lina que esto es debido a un oscuro legado, en verdad, el ejército del dragón está dirigida por su hija y sus batallas son por encima de su asignación. Lina se compromete a ayudar a la regla, mientras que Naga se une a su hija, Marlene.